Организационная структура МФСА

• Совет Глав государств центральной Азии по проблемам бассейна аральского моря
  • Президент мфса
    • Правление международного фонда спасения арала
      • Ревиззионная комиссия
      • Межгосударственная кординационная водохозяйственная комиссия (мквк)
        • Секретариат
        • Ниц мквк
        • Бво сырдарья
        • Бво амурдарья
        • Координационный метрологический центр (кмц)
      • Межгосударственная комиссия по устойчивому развитию (мкур)
        • Секретариат
        • Ниц мкур
      • Исполнительный комитет международного фонда спасения Арала
        • Исполнительная дирекция в Казахстане
          • Кызылординское отделение
        • Исполнительная дирекция в Кыргызстане
        • Филиал в Таджикистане
        • Филиал в Дашогузе (Туркменистан)
        • Агенство пбам в Узбекистане
          • Нукуский филиал
        • Региональный центр гидрологии

Президентами Фонда в разные годы являлись:

1993-1997гг.
Президент Казахстана Н.А.Назарбаев

1997-1999гг.
Президент Узбекистана И.А.Каримов

1999-2002гг.
Президент Туркменистана С.Ниязов

2002-2008гг.
Президент Таджикистана Э.Рахмон

2008-2013 гг.
Президент Казахстана Н.А.Назарбаев

2013-2016 гг.
Президент Узбекистана И.А.Каримов

2016-по настоящее время
Президент Туркменистана Г. М. Бердымухаммедов